腰部本身有疾病

打坐是需要保持腰部挺直长时间的，如果腰部本身就是有疾病的，像腰肌劳损、腰部扭伤等，再进行打坐是会引发旧疾而产生疼痛。

打坐坐姿不对

有时候因为不能坚持打坐的正确坐姿，出现弯腰弓背的情况，对腰部的压力变大，是腰肌很容易变得疲劳，长久下来会导致腰肌劳损的情况。

打坐时间过长

因为长时间的打坐，腰部保持一个姿势时间过久，强度过大，腰部肌肉容易发生酸痛情况。

由脊柱病变引起疼痛

打坐时经常会发生睡觉的情况，而睡觉的姿势必然会低头含胸，脊柱的负担变大，长久下来，可能会影响脊柱外形甚至脊柱病变，而脊柱病变又比较容易引起腰部疼痛。