各个单位为了确保正常运行，都会建立一套规章制度，实际上在建立之初，就应该与法律法规相衔接。但如果出现了本单位的规章制度，与囯家或上级有关法律法规相抵触，甚至矛盾或冲突，毫无疑问，应该在遵照法律法规的基础上，修改本单位的规章制度！

部门规章制度是要求在法律规定的范围内，按照法律规定制定的，部门制度只是单位自行制定的内部使用的，而法律是国家层面的规定，属于上位法，所以部门规章制度与法律冲突了，那肯定是按照法律的规定来的，这才是权威的。