棉签掏耳朵会损伤外耳道的皮肤，导致外耳道皮肤发炎，出现红肿、流水、流脓、疼痛等症状。

棉签掏耳朵有时会导致棉签头脱落，留在外耳道的深部形成外耳道的异物，导致听力的下降，有耳道的堵塞感，需要到医院取出。

棉签掏耳朵的时候可能会导致鼓膜的损伤，出现外伤导致鼓膜穿孔的情况。

棉签掏耳朵是有危害的，外耳道不需要使用棉签清洁，有一定的自净功能，外耳道的耵聍会自行排出。

如果耵聍较多或者有异物时，需要到医院进行外耳道冲洗。