使用睫毛膏有可能引起眼部感染，特别是绿脓杆菌所引起的角膜感染，严重的还会对视力造成永久性的伤害；

表皮葡萄球菌和金黄葡萄球菌也能在被污染的睫毛膏里繁殖。

如果睫毛膏随着泪水被带入结膜囊的话，睫毛膏里所含的颜料会导致结膜色素沉淀；

睫毛膏中所含的树脂(松香)以及防水性眼部彩妆卸妆液，也都是可能造成眼睑发炎过敏的因素之一。