扁平疣能够治愈，只不过是治疗的全过程较为长，并且需要依据扁平疣的形状.总数.遍布的部位明确治疗的方式。

患上人类乳头瘤病毒后，扁平疣本身就是一种皮肤赘生物，如果数量不多，可以用激光来祛除，它在局部涂抹重组人干扰素凝胶可有效预防该病反复发作。

若扁平疣数量较多，且分布面积较大，可采用皮下埋入法。

这类皮下组织埋进术关键指的是切取一个新生长出来的扁平疣，随后栽种到手臂两侧三角肌内使本身针对这类人们乳头瘤病毒产生抗原，进而使全身的扁平疣慢慢掉下来。

但是这类治疗方式有效率只有75%，有的情况下需要2次治疗或是3次治疗才能够。