1、材质不同:医用棉签有非常严格的制作要求，是根据国家的标准及医药内的行业标准要求制作的。

医用的棉签一般使用医用脱脂棉和天然桦木制成。

而普通棉签多为普通的棉花、海绵头或者布头。

2、特点不同:医用棉签的使用要求必须是无毒、对人的皮肤或者机体没有刺激性，有很好的吸水性。

而普通棉签用途很广泛，其制作成本低，使用没有严格的要求。

3、产品等级不同:医用棉签因一般多用于处理伤口，因此要求必须是灭菌级的产品，开袋就可以使用。

普通棉签一般都是导电级产品。

4、储存条件不同:医用棉签要求保管在无腐蚀性和通风效果良好的室内，不能高温，相对湿度不能超过80%。

而普通棉签在这方面基本没有太严格的要求，只要有一定的防尘、防水就可以存放。