怀孕期间做亲子鉴定有以下两方面的办法:

第一、做无创亲子鉴定，原理与无创dna一致，是通过抽取孕妇的外周血，提取孕妇外周血液中的胎儿DNA，将胎儿的DNA与男方的DNA进行比对，鉴定胎儿是否与此男性有亲子关系。

第二、通过羊水穿刺提取羊水，然后分离羊水中的脱落细胞并进行培养。

羊水中的脱落细胞代表胎儿的染色体和DNA，将脱落细胞当中的DNA进一步提取，然后与男方的DNA进行对比，这样也能够进行亲子鉴定。

这两种方法中，无创亲子鉴定的准确性可以达到99%，羊水亲子鉴定能够达到99.99%。